Początki firmy sięgają sklepu z nasionami nad Sekwaną, otwartego w 1743 roku. Jego założyciel, Pierre Andrieux, był głównym dostawcą nasion na dworze króla Ludwika XV. Vilmorin jest najstarszą firmą nasienną na świecie, zasłynęła też z wydania pierwszego na świecie katalogu nasion.

Obecnie Vilmorin jest jedną z wiodących firm nasiennych w krajach basenu Morza Śródziemnego, USA i Kanadzie, posiada również stacje badawcze na całym świecie, m.in. w Chile, Turcji, czy Nowej Zelandii. Vilmorin wydaje produkty zarówno pod własną marką, jak i innymi markami własnościowymi, między innymi Eden i Vitaline.

Firma należy w 70% do grupy Limagrain, pozostałe 30 notowane jest na giełdzie w Paryżu.